41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4584 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  48.09 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  37.6 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  35.94 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  35.48 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  36 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  39.84 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  37.3 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  36.51 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  37.3 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  36.51 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  35.71 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  38.39 
 
 		 442 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  35.71 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  34.51 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  35.21 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  37.21 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  35.16 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  35.16 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  35.21 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  34.92 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  35.38 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  39.33 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  31.51 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  35.43 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  31.78 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  30.81 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  32.74 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  43.94 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  30.3 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  31.01 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  45.9 
 
 		 171 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1136  hypothetical protein  45.83 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  32.14 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  30.63 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  49.02 
 
 		 92 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  49.12 
 
 		 89 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  46.55 
 
 		 88 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  47.37 
 
 		 89 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  32.95 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  35 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>