54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2737 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  86.83 
 
 		 209 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  49.76 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  48.53 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  51.49 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  46.39 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  45.54 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  40.1 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  40.4 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  40.59 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  39.7 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  39.6 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  39.6 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  35.71 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  34.83 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  35.16 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  35 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  35 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  44.19 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  35.56 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  35.56 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  35 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  35 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  34.44 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  34.46 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  32.22 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  31.67 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  32.97 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  32.97 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  35.37 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  39.85 
 
 		 138 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  31.67 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  33.52 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  31.96 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  29.85 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  28.92 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  31.54 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  32.71 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  31.78 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  39.47 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  34.18 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  40.91 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  40.91 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  32.41 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  39.06 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  39.08 
 
 		 135 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  38.16 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  34.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  51.02 
 
 		 89 aa  44.7  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  32.99 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  41.33 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  29.3 
 
 		 250 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  36.51 
 
 		 142 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  46.94 
 
 		 88 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>