59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3817 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 
208 aa  427  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  48.53 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  48.29 
 
 
209 aa  198  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  44.88 
 
 
206 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  48.98 
 
 
206 aa  181  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  44.85 
 
 
204 aa  181  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  44.85 
 
 
203 aa  161  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  32.82 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  37.5 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  32.31 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  33.51 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  32.31 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  36.26 
 
 
194 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  36.26 
 
 
194 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  33.51 
 
 
193 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  33.16 
 
 
194 aa  104  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  32.62 
 
 
194 aa  101  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  33.16 
 
 
191 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  33.16 
 
 
191 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  32.62 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  32.62 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  32.2 
 
 
202 aa  97.8  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  39.17 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  31.64 
 
 
247 aa  95.1  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  29.83 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  30.22 
 
 
189 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  30.81 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  30.81 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  28.04 
 
 
192 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  30.21 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  27.23 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  33.86 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  35.51 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  38.52 
 
 
253 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  31.51 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  34.09 
 
 
292 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  30.65 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  38.81 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  36.78 
 
 
184 aa  55.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  27.13 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  35.29 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  57.78 
 
 
89 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  58.14 
 
 
88 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  57.14 
 
 
89 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  37.21 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  29.2 
 
 
442 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  31.2 
 
 
116 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  34.78 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  31.25 
 
 
142 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  26.42 
 
 
114 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  37.93 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  32.22 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  35.96 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  42.42 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  34.85 
 
 
139 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1136  hypothetical protein  29.55 
 
 
146 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.647235  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  55.56 
 
 
36 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>