50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4026 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  52.48 
 
 
209 aa  202  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  51.49 
 
 
205 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 
203 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  48.98 
 
 
208 aa  181  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  45.36 
 
 
206 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  43.41 
 
 
204 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  37.76 
 
 
198 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  39.15 
 
 
194 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  39.15 
 
 
194 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  38.92 
 
 
202 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  37.56 
 
 
200 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  36.46 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  37.91 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  37.36 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  37.91 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  37.36 
 
 
191 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  37.91 
 
 
191 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  37.36 
 
 
191 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  37.31 
 
 
200 aa  118  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  37.63 
 
 
190 aa  118  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  35.98 
 
 
200 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  35.53 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  35.53 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  34.39 
 
 
189 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.220507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  41.35 
 
 
247 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  32.28 
 
 
189 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  39.69 
 
 
218 aa  98.6  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  32.97 
 
 
192 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  31.25 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  31.25 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  36.09 
 
 
138 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  32.97 
 
 
193 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  30.3 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  34 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  39.84 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  33.14 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  28.51 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  38.89 
 
 
171 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  35.19 
 
 
442 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  55.1 
 
 
184 aa  55.1  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  45.28 
 
 
212 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  35.9 
 
 
140 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  34.52 
 
 
170 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  31.87 
 
 
114 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  35.71 
 
 
142 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  44.44 
 
 
89 aa  45.1  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  42.86 
 
 
88 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  42.59 
 
 
89 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  27.57 
 
 
223 aa  41.6  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>