49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00847 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  89 
 
 		 200 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  86 
 
 		 200 aa  355  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  85 
 
 		 200 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  62.24 
 
 		 197 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  50.25 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  83.49 
 
 		 114 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  39.9 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  39.3 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  39.6 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  41.42 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  37.91 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  36.27 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  35.53 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  32.31 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  35.33 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  33.69 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  71.62 
 
 		 137 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  34.97 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  34.97 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  33.68 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  35.14 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  35.14 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  33.33 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  31.44 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  34.05 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  36.22 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  33.51 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  34.55 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  34.55 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  36.23 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  29.9 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  35.66 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  30.73 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  34.62 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  42.68 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  50 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  28.39 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  28.5 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  38.89 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  36.11 
 
 		 147 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  33.75 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  36.11 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  29.52 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  40.58 
 
 		 210 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  37.68 
 
 		 139 aa  41.2  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  26.42 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>