49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3034 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  97.5 
 
 
200 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  86 
 
 
200 aa  358  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  85 
 
 
200 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  85 
 
 
200 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  63.02 
 
 
197 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  49.75 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  85.32 
 
 
114 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  39.18 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  40.91 
 
 
209 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  40.4 
 
 
205 aa  138  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  45.88 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  36.36 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  35.53 
 
 
203 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  37.31 
 
 
206 aa  118  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  32.82 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  32.62 
 
 
190 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  33.7 
 
 
193 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  70.27 
 
 
137 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  33.33 
 
 
194 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  33.33 
 
 
194 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  32.63 
 
 
194 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  32.63 
 
 
194 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  33.88 
 
 
191 aa  101  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  33.88 
 
 
191 aa  101  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  35 
 
 
202 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  32.79 
 
 
191 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  32.79 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  34.55 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  34.55 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  32.8 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  32.97 
 
 
192 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  31.75 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.220507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  34.27 
 
 
247 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  32.61 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  32.31 
 
 
138 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  41.46 
 
 
142 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  40.58 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  29.38 
 
 
292 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  28.57 
 
 
293 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 
145 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 
146 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  33.75 
 
 
145 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  35 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  33.75 
 
 
147 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  25.31 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  26.67 
 
 
253 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  29.52 
 
 
138 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  29.73 
 
 
145 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>