66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1124 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  100 
 
 		 193 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  100 
 
 		 193 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  91.1 
 
 		 189 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  87.43 
 
 		 189 aa  347  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  86.98 
 
 		 192 aa  338  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  87.43 
 
 		 193 aa  330  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  64.62 
 
 		 194 aa  258  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  63.27 
 
 		 194 aa  257  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  63.27 
 
 		 194 aa  257  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  62.69 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  62.69 
 
 		 191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  62.69 
 
 		 191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  63.73 
 
 		 194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  62.18 
 
 		 191 aa  250  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  63.21 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  60.21 
 
 		 190 aa  238  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  74.4 
 
 		 293 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  59.47 
 
 		 202 aa  231  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  57.82 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  55.4 
 
 		 138 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  76.11 
 
 		 442 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  34.9 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  36.9 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  32.97 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  36.31 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  32.97 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  35.08 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  34.55 
 
 		 200 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  34.55 
 
 		 200 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  34.55 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  34.55 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  33.88 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  65.22 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  31.25 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  30.81 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  72.88 
 
 		 78 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  32.79 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  50 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  59.68 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  32.12 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  47.25 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  58.06 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  49.41 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  61.67 
 
 		 89 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  56.45 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  59.02 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  54.84 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  55.56 
 
 		 89 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  50 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  30.23 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  35.16 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  58 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  68.42 
 
 		 47 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  38.79 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  27.78 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  41.86 
 
 		 92 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  36.29 
 
 		 138 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  34.68 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  29.25 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  26.62 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  38.36 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  31.4 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  40.3 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  38.36 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  40.98 
 
 		 131 aa  42  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>