48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0300 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  100 
 
 
197 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.656983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  65.5 
 
 
200 aa  246  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  62.24 
 
 
200 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  65.1 
 
 
200 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  62.24 
 
 
200 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  63.02 
 
 
200 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  89.32 
 
 
114 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  39.09 
 
 
198 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  72.97 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  39.18 
 
 
202 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  33.89 
 
 
190 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  34.95 
 
 
194 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  34.41 
 
 
194 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  33.51 
 
 
193 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  33.16 
 
 
191 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  33.16 
 
 
191 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  33.68 
 
 
191 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  33.68 
 
 
191 aa  97.8  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  33.88 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  33.88 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  33.15 
 
 
189 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  32.6 
 
 
189 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  30.57 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  30.3 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  30.85 
 
 
192 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  31.96 
 
 
205 aa  87.8  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  32.79 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  32.79 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  30.93 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  27.23 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  35.86 
 
 
247 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  30.05 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  31.05 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  27.18 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  31.65 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  30.18 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  42.68 
 
 
142 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  30.63 
 
 
293 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  29.58 
 
 
250 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.40687 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  35 
 
 
147 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  32.5 
 
 
147 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1450  tail fiber assembly protein, putative  29.2 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  33.85 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  29.57 
 
 
138 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 
210 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>