22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1450 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1450  tail fiber assembly protein, putative  100 
 
 		 178 aa  353  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2747  tail fiber assembly protein, putative  86.32 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0752  hypothetical protein  49.25 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0258  hypothetical protein  64 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0657  tail fiber assembly protein, putative  73.03 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1306  hypothetical protein  44.54 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000530633 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  35.71 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  36.36 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  38.1 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  36.36 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  37.21 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1636  hypothetical protein  56.67 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  36.9 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  36.9 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  27.1 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  29.2 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  28.85 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  29.79 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>