74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0872 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  85.11 
 
 		 194 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  84.57 
 
 		 194 aa  335  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  84.57 
 
 		 194 aa  334  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  83.68 
 
 		 191 aa  332  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  83.51 
 
 		 194 aa  332  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  83.16 
 
 		 191 aa  331  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  83.51 
 
 		 193 aa  330  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  82.63 
 
 		 191 aa  328  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  82.63 
 
 		 191 aa  328  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  61.9 
 
 		 189 aa  250  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  60 
 
 		 189 aa  241  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  57.89 
 
 		 202 aa  239  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  60.21 
 
 		 193 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  60.21 
 
 		 193 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  79.14 
 
 		 247 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  57.67 
 
 		 192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  59.16 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  70.15 
 
 		 138 aa  205  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  47.9 
 
 		 293 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  35.96 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  34.83 
 
 		 205 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  37.63 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  34.97 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  34.08 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  33.69 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  32.6 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  33.69 
 
 		 200 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  33.69 
 
 		 200 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  32.62 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  32.62 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  33.89 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  46.85 
 
 		 442 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  26.62 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  60.38 
 
 		 89 aa  72  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  41.57 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  33.15 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  57.69 
 
 		 88 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  57.69 
 
 		 89 aa  67.4  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  47.62 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  43.55 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  33.67 
 
 		 114 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  36.47 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  49.15 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  28.21 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  38.03 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  25.45 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  52.17 
 
 		 82 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  47.37 
 
 		 78 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  39.13 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  35.42 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  62.86 
 
 		 36 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  40.62 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  44.44 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  35.42 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  42.11 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1450  tail fiber assembly protein, putative  36.36 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  46.77 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  37.1 
 
 		 116 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  40.62 
 
 		 135 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  32.89 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  30.63 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1332  tail fiber assembly protein from lambdoid prophage e14  26.04 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  57.14 
 
 		 47 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  38.1 
 
 		 131 aa  45.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1861  bacteriophage-acquired protein  28.8 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  31.07 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1636  tail fiber assembly protein, truncation  60.71 
 
 		 30 aa  41.6  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5072  tail fiber assembly protein  32.04 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0684  tail fiber assembly protein  32.04 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>