35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4023 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 
131 aa  265  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  44.2 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  43.84 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  36.9 
 
 
210 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  27.41 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  25.93 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1013  tail fiber assembly protein  31.3 
 
 
181 aa  52  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  32.47 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2595  tail fiber assembly protein  31.58 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  30.3 
 
 
177 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  35.21 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  29.87 
 
 
139 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  33.8 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  35.82 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  38.1 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  31.08 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  28.57 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  32.43 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  34.85 
 
 
193 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  35.82 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 
247 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  33.33 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  33.33 
 
 
194 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  40.98 
 
 
193 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  40.98 
 
 
193 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  33.33 
 
 
194 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  32.61 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  26.67 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  31.82 
 
 
194 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  25.97 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  24.68 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  24.68 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  25.97 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  28.57 
 
 
184 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>