22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1452 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  43.18 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  40.11 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  35.79 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  38.64 
 
 		 170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1013  tail fiber assembly protein  35.79 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2595  tail fiber assembly protein  38.22 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  37.95 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  32.24 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  33.16 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  34.23 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  35.57 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  34.16 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  26.97 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  42.37 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  25.95 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  25.95 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  32.35 
 
 		 175 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  31.31 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  31.37 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  31.08 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>