37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0929 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 172 aa  357  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  32.76 
 
 		 175 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  28.74 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  30.9 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  30.34 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  30.27 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  31.64 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  34.16 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  29.21 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  29.21 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  27.38 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  30.49 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  29.22 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1013  tail fiber assembly protein  28.18 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  28.74 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  27.13 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  25.53 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  28.66 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2595  tail fiber assembly protein  25.61 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  24.5 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  32.69 
 
 		 202 aa  52  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  31.9 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  32.76 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  32.76 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  31.4 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  31.4 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  31.9 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  29.13 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  30.56 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  31.9 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  41.27 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  31.03 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  29.07 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  28.95 
 
 		 139 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  30.84 
 
 		 194 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  39.68 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  30.17 
 
 		 247 aa  40.8  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>