69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0864 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 184 aa  384  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  41.49 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  39.78 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  40.11 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  42.08 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  41.18 
 
 		 175 aa  121  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  37.42 
 
 		 170 aa  117  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1452  hypothetical protein  35.79 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000363258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1040  hypothetical protein  34.22 
 
 		 177 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  31.11 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  30.27 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  31.35 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  34.57 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  34.21 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  34.21 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1013  tail fiber assembly protein  27.6 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  30.81 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  43.88 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  53.03 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  54.55 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  55.38 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  41.51 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  42.86 
 
 		 89 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  53.85 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  53.85 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  55.38 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  53.85 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2595  tail fiber assembly protein  25.4 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  47.62 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  52.31 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  52.31 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  52.31 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  52.31 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  48.1 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  42.2 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  39.47 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  38.79 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0711  putative bacteriophage tail protein  25.26 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.664005  normal  0.0192003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1179  tail fibre assembly protein  28.04 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.376111  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  38.79 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  50.94 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  55.1 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  36.78 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  40.26 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  41.67 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  55.1 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  35.4 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  50.85 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  31.16 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  39.47 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  38.05 
 
 		 209 aa  50.8  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  40 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  39.13 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  38.57 
 
 		 145 aa  47.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  43.75 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  37.31 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  61.11 
 
 		 36 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2241  phage tail assembly protein  50 
 
 		 47 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.206119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  44.83 
 
 		 92 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  47.46 
 
 		 78 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  38.57 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0627  hypothetical protein  39.34 
 
 		 116 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  50 
 
 		 442 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  45.76 
 
 		 293 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3397  tail fiber assembly domain protein  33.73 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  37.68 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4854  tail assembly chaperone gp38  26.9 
 
 		 292 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>