56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0915 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 142 aa  286  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  50.74 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  47.59 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  46.94 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2346  hypothetical protein  38.66 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  35 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  35 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2471  tail fiber assembly protein  37.5 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  32.12 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  34.56 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  53.03 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  51.47 
 
 		 193 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  51.52 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  50 
 
 		 194 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  50 
 
 		 194 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  63.04 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  48.48 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  50 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  43.42 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  49.15 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  63.64 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  41.67 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  61.36 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  30.5 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  45.31 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  29.79 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2782  putative phage tail fiber assembly protein  33.33 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3473  putative phage tail fiber assembly protein  33.33 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00673072  hitchhiker  0.00000114325 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  39.73 
 
 		 170 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2472  putative phage tail fiber assembly protein  35.53 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  31.25 
 
 		 208 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  44.23 
 
 		 204 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  43.33 
 
 		 442 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  35.71 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2849  putative phage tail fiber assembly protein  32 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3032  putative phage tail fiber assembly protein  32 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  44.44 
 
 		 293 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  27.86 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  46.3 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  25.52 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01356  hypothetical protein  58.33 
 
 		 36 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  44.44 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  45.45 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  41.27 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  32.86 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  44.26 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  42.19 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  36.51 
 
 		 205 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  43.64 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  32.39 
 
 		 172 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>