42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2808 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  50.74 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  38.26 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  38.93 
 
 		 145 aa  87.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  28.06 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  29.8 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  30.28 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  35.59 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  50.85 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  48.33 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  42.11 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  39.13 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  47.46 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  31.75 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  45.76 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  45.76 
 
 		 194 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  28.87 
 
 		 192 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0692  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  53.33 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2471  tail fiber assembly protein  26.55 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  51.16 
 
 		 293 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  42.03 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  44.07 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  54.55 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  33.68 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  33.68 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  37.11 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  45.76 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  40 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  45.76 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  45.76 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  45.76 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  43.1 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  27.34 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  42.62 
 
 		 442 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  38.1 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  44.44 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  26.62 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2346  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  37.68 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0929  tail assembly chaperone gp38  28.95 
 
 		 172 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>