75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2023 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2792  phage tail assembly protein  82.94 
 
 		 192 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  76.65 
 
 		 189 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1091  tail fiber assembly like-protein  74.4 
 
 		 193 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1124  tail fiber assembly like-protein  74.4 
 
 		 193 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1162  phage tail assembly protein  80.24 
 
 		 193 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  70.06 
 
 		 189 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2793  appr-1-p processing enzyme family protein  90.6 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  94.78 
 
 		 442 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  55.23 
 
 		 194 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  56.69 
 
 		 191 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  53.85 
 
 		 194 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  56.69 
 
 		 191 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  56.69 
 
 		 191 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  53.85 
 
 		 194 aa  185  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  56.05 
 
 		 191 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  56.05 
 
 		 194 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  55.41 
 
 		 193 aa  180  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  52.87 
 
 		 202 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  47.9 
 
 		 190 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  54.17 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2667  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  53.96 
 
 		 138 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000342551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2077  putative Tail fiber assembly protein homolog from lambdoid prophage  97.44 
 
 		 78 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.865934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0008  appr-1-p processing domain-containing protein  40.68 
 
 		 209 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00352101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0143  appr-1-p processing domain-containing protein  44.54 
 
 		 210 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4137  Appr-1-p processing domain-containing protein  36.36 
 
 		 195 aa  92.4  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1181  phage tail assembly protein  67.21 
 
 		 212 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128725  normal  0.507373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1578  tail assembly chaperone gp38  33.15 
 
 		 206 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3377  Appr-1-p processing domain protein  41.46 
 
 		 222 aa  86.3  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.590192  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6708  Appr-1-p processing domain protein  38.14 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  32.16 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1996  appr-1-p processing domain-containing protein  37.07 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  29.8 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  28.51 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  29.15 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  33.09 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0273  phosphatase like to the domain of histone macroH2A1  39.29 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  29.49 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4584  hypothetical protein  35.38 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1167  hypothetical protein  34.23 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  28.39 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  30.63 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  28.39 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  50 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  27.13 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01180  predicted phosphatase, C-terminal domain of histone macro H2A1 like protein  33.61 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  29.22 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1018  domain of unknown function superfamily  55 
 
 		 89 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1816  tail assembly chaperone gp38  30.77 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1693  putative tail fiber assembly protein  33.83 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4536  tail assembly chaperone gp38  50.85 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1287  hypothetical protein  54.1 
 
 		 88 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4484  fels-2 prophage Tfa  53.23 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667838 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  28.57 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1481  hypothetical protein  60.42 
 
 		 89 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1041  tail fiber assembly protein  46.77 
 
 		 175 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1649  hypothetical protein  60.42 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0560  Appr-1-p processing domain protein  40.26 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2245  tail fibre assembly protein  50 
 
 		 191 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.203729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3934  tail fiber assembly domain protein  50.85 
 
 		 92 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.329117  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2917  gp20  50 
 
 		 184 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000431105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2248  tail fibre assembly protein  48.39 
 
 		 189 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  0.0191613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4342  tail fiber assembly protein GpG  46.67 
 
 		 175 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.894245  normal  0.082245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2197  hypothetical protein  34.72 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.107741  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06361  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.84373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  100 
 
 		 805 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  100 
 
 		 791 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  100 
 
 		 790 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  100 
 
 		 463 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  100 
 
 		 569 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0864  tail assembly chaperone gp38  43.08 
 
 		 184 aa  45.8  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344022  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  51.16 
 
 		 139 aa  45.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  95 
 
 		 580 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  44.44 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1920  putative tail fiber assembly-like protein  30.86 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>