94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4381 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  100 
 
 		 580 aa  1194    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  67.32 
 
 		 570 aa  347  4e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  81.64 
 
 		 673 aa  326  9e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  45.15 
 
 		 790 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  43.74 
 
 		 791 aa  296  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  73.3 
 
 		 805 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  73.3 
 
 		 463 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  73.3 
 
 		 569 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  59.23 
 
 		 583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  52.19 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  50.2 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  51.65 
 
 		 1007 aa  233  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  51 
 
 		 493 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  56.94 
 
 		 516 aa  226  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  57.01 
 
 		 1120 aa  226  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  57.22 
 
 		 660 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  54.62 
 
 		 1137 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  54.51 
 
 		 536 aa  221  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  54.62 
 
 		 441 aa  216  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  54.51 
 
 		 281 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  52.56 
 
 		 320 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  43.11 
 
 		 554 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  37.61 
 
 		 962 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  47.26 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  54.09 
 
 		 697 aa  173  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  53.75 
 
 		 399 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  54.72 
 
 		 401 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  43.46 
 
 		 504 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  52.2 
 
 		 340 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  48.88 
 
 		 540 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  48.88 
 
 		 540 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  54.09 
 
 		 479 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  54.19 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  57.42 
 
 		 557 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  51.57 
 
 		 485 aa  165  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  51.88 
 
 		 371 aa  164  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  56.6 
 
 		 473 aa  163  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  50.94 
 
 		 646 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  50.94 
 
 		 419 aa  158  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  47.55 
 
 		 561 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  53.12 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  67.5 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  52.83 
 
 		 588 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  48.47 
 
 		 689 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  47.5 
 
 		 554 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  44.38 
 
 		 714 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  39.58 
 
 		 505 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  41.78 
 
 		 691 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  42.04 
 
 		 817 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  40.36 
 
 		 242 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  38.26 
 
 		 483 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  34.62 
 
 		 251 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  35.15 
 
 		 205 aa  91.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  33.55 
 
 		 359 aa  88.2  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  33.03 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  34.38 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  33.33 
 
 		 179 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  67.92 
 
 		 701 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  48.51 
 
 		 670 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  62.5 
 
 		 670 aa  74.3  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  31.43 
 
 		 382 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  43.09 
 
 		 589 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  32.63 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  38.46 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  32.8 
 
 		 259 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  47.83 
 
 		 682 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  61.29 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  31.25 
 
 		 262 aa  67  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  29.84 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  31.71 
 
 		 531 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  24.04 
 
 		 402 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  47.22 
 
 		 183 aa  62  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  57.14 
 
 		 645 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  42.5 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  39.53 
 
 		 621 aa  59.7  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  41.25 
 
 		 176 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  59.26 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  59.26 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  56.25 
 
 		 172 aa  54.7  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  28.23 
 
 		 616 aa  54.3  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  56.86 
 
 		 280 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  27.81 
 
 		 525 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  58.33 
 
 		 892 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  38.68 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  29.84 
 
 		 590 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  36.99 
 
 		 144 aa  47.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  30.63 
 
 		 532 aa  47  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  30.05 
 
 		 690 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1209  putative pyocin R2_PP, tail fiber protein  32.69 
 
 		 228 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391701 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2023  tail fibre assembly protein  95 
 
 		 293 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0278369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  27.15 
 
 		 735 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12450  hypothetical protein  53.33 
 
 		 933 aa  45.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277877  normal  0.37002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>