54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4029 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  100 
 
 		 419 aa  850    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  92.02 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  74.18 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  69.86 
 
 		 697 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  71.36 
 
 		 401 aa  305  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  71.62 
 
 		 498 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  45.34 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  69.82 
 
 		 557 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  65.74 
 
 		 473 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  65.74 
 
 		 540 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  65.74 
 
 		 540 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  62.96 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  63.43 
 
 		 588 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  64.35 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  68.89 
 
 		 479 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  62.84 
 
 		 561 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  66.18 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  44.04 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  74.68 
 
 		 660 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  67.72 
 
 		 583 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  58.14 
 
 		 714 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  57.52 
 
 		 554 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  56.77 
 
 		 504 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  54.55 
 
 		 689 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  53.59 
 
 		 554 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  43.84 
 
 		 673 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  51.9 
 
 		 570 aa  157  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  48.1 
 
 		 552 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  35.02 
 
 		 581 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  48.1 
 
 		 493 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  51.11 
 
 		 580 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  43.31 
 
 		 251 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  47.17 
 
 		 691 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  37.43 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  38.51 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  39.43 
 
 		 205 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  43.62 
 
 		 817 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  34.32 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  32.95 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  39.6 
 
 		 242 aa  97.1  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  36.67 
 
 		 298 aa  93.2  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  32.11 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  35.2 
 
 		 527 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  29.06 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  33.77 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  35.25 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  34.03 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  46.77 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  51.79 
 
 		 682 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  47.06 
 
 		 200 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  40.32 
 
 		 621 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  38.71 
 
 		 689 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  59.46 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3056  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  31.9 
 
 		 292 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>