45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1384 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  100 
 
 
504 aa  1016    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  56.9 
 
 
660 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  52.29 
 
 
583 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  61.59 
 
 
498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  46.05 
 
 
493 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  41.24 
 
 
552 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  46.05 
 
 
581 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  52.97 
 
 
340 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  58.97 
 
 
399 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  53.85 
 
 
479 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  51.11 
 
 
399 aa  187  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  56.41 
 
 
697 aa  186  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  56.13 
 
 
401 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  56.05 
 
 
371 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  60.26 
 
 
557 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  56.77 
 
 
646 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  56.77 
 
 
419 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  50.29 
 
 
570 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  58.06 
 
 
540 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  58.06 
 
 
540 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  52.9 
 
 
485 aa  176  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  58.06 
 
 
473 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  46.32 
 
 
452 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  46.86 
 
 
554 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  57.05 
 
 
561 aa  170  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  51.88 
 
 
554 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  55.77 
 
 
588 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  46.67 
 
 
673 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  51.95 
 
 
714 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  47.85 
 
 
689 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  43.01 
 
 
580 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  45.16 
 
 
251 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  45.7 
 
 
205 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  38.41 
 
 
817 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  37.69 
 
 
505 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  36.05 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  33.55 
 
 
483 aa  103  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  34.15 
 
 
242 aa  100  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  38.18 
 
 
691 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  33.13 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  35.57 
 
 
525 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  31.91 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  29.23 
 
 
519 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  37.58 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  37.14 
 
 
531 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>