71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2380 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  100 
 
 		 590 aa  1162    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  69.23 
 
 		 525 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6581  hypothetical protein  27.64 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  37.58 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  26.42 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  34.03 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  33.56 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  34.44 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  50 
 
 		 492 aa  72  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 		 340 aa  72  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  31.51 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4816  hypothetical protein  46.51 
 
 		 317 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1427  hypothetical protein  46.51 
 
 		 299 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000465775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  34.84 
 
 		 697 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  33.54 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  31.79 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  32 
 
 		 660 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  31.79 
 
 		 498 aa  65.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1424  hypothetical protein  44.05 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.718743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  31.29 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  32.45 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  31.21 
 
 		 714 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  29.66 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  32.88 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  29.93 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  28.08 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1932  hypothetical protein  28.93 
 
 		 288 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  34.19 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  31.13 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  31.13 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  31.13 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  38.55 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  28 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  32.3 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  28 
 
 		 493 aa  57  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  30.46 
 
 		 583 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  30.56 
 
 		 554 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  31.33 
 
 		 519 aa  55.1  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  32.09 
 
 		 232 aa  55.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  26.67 
 
 		 581 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  39.66 
 
 		 455 aa  53.9  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  37.66 
 
 		 150 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  27.46 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  29.8 
 
 		 588 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  31.13 
 
 		 299 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1722  hypothetical protein  32.95 
 
 		 372 aa  51.6  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  30.71 
 
 		 382 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  28.29 
 
 		 691 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  29.56 
 
 		 483 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  26.45 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  38.98 
 
 		 278 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  38.98 
 
 		 278 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  32.43 
 
 		 640 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1725  hypothetical protein  28.74 
 
 		 277 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  hitchhiker  0.0022695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  29.84 
 
 		 580 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  37.68 
 
 		 1065 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  30.77 
 
 		 544 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  29.84 
 
 		 673 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  29.07 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  40.35 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  38.6 
 
 		 360 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  38.6 
 
 		 360 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  27.08 
 
 		 242 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  36.49 
 
 		 152 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  29.33 
 
 		 555 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2243  hypothetical protein  48.44 
 
 		 466 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  29.33 
 
 		 555 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  31.76 
 
 		 555 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  29.33 
 
 		 555 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  27.4 
 
 		 570 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  43.86 
 
 		 418 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>