46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4297 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  94.95 
 
 		 555 aa  1007    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  94.95 
 
 		 555 aa  1007    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  94.23 
 
 		 555 aa  1005    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1099    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  92.97 
 
 		 554 aa  1018    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2438  hypothetical protein  62.28 
 
 		 840 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  70.05 
 
 		 360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  69.12 
 
 		 360 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  69.12 
 
 		 360 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  53.88 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  49.81 
 
 		 358 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  44 
 
 		 455 aa  213  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4120  hypothetical protein  46.96 
 
 		 1371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  41.83 
 
 		 611 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  44.75 
 
 		 640 aa  180  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  46.7 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  43.64 
 
 		 278 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  45.91 
 
 		 608 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  43.18 
 
 		 278 aa  171  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  43.32 
 
 		 476 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  46.21 
 
 		 433 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  45.83 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  41.67 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  41.38 
 
 		 336 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1998  hypothetical protein  42.16 
 
 		 497 aa  120  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054926 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  49.09 
 
 		 117 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  50.91 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1761  hypothetical protein  34.93 
 
 		 805 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  46.9 
 
 		 238 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5633  hypothetical protein  34.23 
 
 		 866 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.175065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  49 
 
 		 243 aa  87  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  38.33 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  41.12 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  46.9 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  37.61 
 
 		 235 aa  79.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  37.24 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  41.23 
 
 		 150 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  43.8 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  37.29 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  36.81 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  29.13 
 
 		 118 aa  53.9  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1065 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  28.16 
 
 		 117 aa  52.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0600  hypothetical protein  35.71 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  32.14 
 
 		 590 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  32.14 
 
 		 547 aa  43.5  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>