40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1417 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  97.22 
 
 
360 aa  697    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  86.39 
 
 
360 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  69.12 
 
 
554 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  74.75 
 
 
555 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  74.75 
 
 
555 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  74.75 
 
 
555 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  69.7 
 
 
555 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  55.86 
 
 
358 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4981  hypothetical protein  51.58 
 
 
418 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000575205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  44.68 
 
 
640 aa  192  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  44.76 
 
 
455 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  44.59 
 
 
476 aa  182  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  47.95 
 
 
278 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  43.36 
 
 
611 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  47.49 
 
 
278 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1825  hypothetical protein  45.45 
 
 
608 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949516  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  46.05 
 
 
544 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2123  hypothetical protein  42.39 
 
 
455 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140853  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4090  hypothetical protein  42.69 
 
 
433 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150292 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3921  hypothetical protein  41.9 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  40.47 
 
 
336 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3719  IS66 Orf2 family protein  55.45 
 
 
423 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0269  hypothetical protein  51.35 
 
 
117 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  48.11 
 
 
232 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3627  hypothetical protein  45.53 
 
 
246 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  48.18 
 
 
238 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3172  hypothetical protein  50 
 
 
233 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0267646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  48 
 
 
243 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2162  hypothetical protein  36.04 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1989  hypothetical protein  45.37 
 
 
150 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.0000737355  normal  0.0314361 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2886  hypothetical protein  38.98 
 
 
240 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0470567  normal  0.128421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1647  hypothetical protein  42.74 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3133  hypothetical protein  41.38 
 
 
152 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0163555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0745  hypothetical protein  26.79 
 
 
118 aa  56.6  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0294492  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0324  hypothetical protein  25.89 
 
 
117 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00000000426021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3059  hypothetical protein  34.07 
 
 
307 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  43.55 
 
 
525 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  38.98 
 
 
341 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  38.6 
 
 
590 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>