15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2243 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2243  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  920    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2412  hypothetical protein  63.64 
 
 		 348 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1801  hypothetical protein  67.9 
 
 		 214 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  43.61 
 
 		 522 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  45.35 
 
 		 510 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  38.14 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3653  hypothetical protein  43.02 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  38.82 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4816  hypothetical protein  32.43 
 
 		 317 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1427  hypothetical protein  45.57 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000465775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  40.51 
 
 		 492 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  48.44 
 
 		 590 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  43.24 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1424  hypothetical protein  27.89 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.718743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1065 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>