42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0298 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  47.45 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  66.67 
 
 		 510 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  65.56 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  39.47 
 
 		 485 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  39.44 
 
 		 179 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  39.44 
 
 		 180 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  38.03 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  38.03 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  40.34 
 
 		 176 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  38.67 
 
 		 371 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  37.57 
 
 		 177 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  36.55 
 
 		 498 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  40.24 
 
 		 166 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  37.64 
 
 		 401 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  39.04 
 
 		 183 aa  89  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  40 
 
 		 646 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  34.39 
 
 		 682 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  38.3 
 
 		 557 aa  85.9  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  32.93 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  36.84 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  39.24 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  37.18 
 
 		 689 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1801  hypothetical protein  53.42 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  35.29 
 
 		 621 aa  79  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2412  hypothetical protein  48.78 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3653  hypothetical protein  45.1 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2243  hypothetical protein  38.14 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  40.82 
 
 		 483 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  29.45 
 
 		 817 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  36.14 
 
 		 735 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  32.43 
 
 		 554 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  82.14 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  37.35 
 
 		 536 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  36.25 
 
 		 654 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  36.25 
 
 		 654 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  30 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  29.46 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  44.44 
 
 		 140 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  29.1 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  40.54 
 
 		 532 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  43.75 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>