26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1178 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  100 
 
 
510 aa  1034    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  78.4 
 
 
701 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  71.43 
 
 
892 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  81.63 
 
 
264 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  53.66 
 
 
520 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  43.9 
 
 
514 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  66.67 
 
 
264 aa  124  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0710  gpH  39.87 
 
 
157 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1801  hypothetical protein  52.17 
 
 
214 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3653  hypothetical protein  53.49 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2412  hypothetical protein  47.06 
 
 
348 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  40.78 
 
 
689 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  30.31 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10057  Tail fiber  65.52 
 
 
87 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00754  hypothetical protein  65.52 
 
 
68 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2243  hypothetical protein  45.35 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  26.46 
 
 
673 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  33.12 
 
 
682 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  36.3 
 
 
570 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  60.98 
 
 
583 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  39.19 
 
 
493 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1639  hypothetical protein  46.77 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  42.86 
 
 
364 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1872  hypothetical protein  45.16 
 
 
374 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.573397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1209  hypothetical protein  34.51 
 
 
346 aa  47  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.852584  normal  0.278976 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4955  hypothetical protein  39.68 
 
 
616 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194752  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>