87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4341 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  100 
 
 		 673 aa  1377    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  81.64 
 
 		 580 aa  326  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  52.37 
 
 		 583 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  61.54 
 
 		 570 aa  292  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  52.2 
 
 		 540 aa  280  7e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  52.2 
 
 		 540 aa  280  7e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  52.49 
 
 		 473 aa  279  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  55.29 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  53.6 
 
 		 697 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  38.52 
 
 		 399 aa  248  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  59.28 
 
 		 660 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  48.12 
 
 		 561 aa  217  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  53.14 
 
 		 554 aa  214  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  50.74 
 
 		 552 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  50.74 
 
 		 493 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  50.25 
 
 		 581 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  49.79 
 
 		 401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  48.95 
 
 		 485 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  48.95 
 
 		 646 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  43.85 
 
 		 371 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  42.56 
 
 		 399 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  44.86 
 
 		 419 aa  177  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  47.26 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  50.2 
 
 		 557 aa  173  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  57.41 
 
 		 479 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  41.39 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  54.72 
 
 		 340 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  56.77 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  50.25 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  49.24 
 
 		 962 aa  161  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  52.72 
 
 		 892 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  50 
 
 		 689 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  50.27 
 
 		 790 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  50 
 
 		 554 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  52.72 
 
 		 280 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  49.73 
 
 		 791 aa  144  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  50.25 
 
 		 805 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  46.88 
 
 		 714 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  34.6 
 
 		 242 aa  135  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  40.44 
 
 		 505 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  41.78 
 
 		 691 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  45.78 
 
 		 442 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  42.04 
 
 		 817 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  66.67 
 
 		 689 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0710  gpH  58.59 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  38.56 
 
 		 483 aa  107  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  62.22 
 
 		 621 aa  107  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  37.82 
 
 		 251 aa  101  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10057  Tail fiber  70 
 
 		 87 aa  97.8  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00754  hypothetical protein  72.73 
 
 		 68 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529655  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  64.1 
 
 		 462 aa  97.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  33.55 
 
 		 359 aa  96.3  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  28.41 
 
 		 510 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  35.12 
 
 		 299 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  33.33 
 
 		 205 aa  90.5  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  35 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  34.9 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0819  hypothetical protein  37.91 
 
 		 264 aa  75.5  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  63.64 
 
 		 701 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  72.92 
 
 		 670 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  72.92 
 
 		 670 aa  74.3  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  49.5 
 
 		 522 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  47.62 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  60.32 
 
 		 340 aa  69.7  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  82.93 
 
 		 401 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2597  Bcv gene product  74.36 
 
 		 39 aa  67  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  82.93 
 
 		 401 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  46.97 
 
 		 1137 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  63.93 
 
 		 639 aa  65.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  45.45 
 
 		 1120 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0533  hypothetical protein  43.82 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  46.59 
 
 		 589 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  34.03 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  47.69 
 
 		 531 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  63.64 
 
 		 172 aa  54.3  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  58.33 
 
 		 387 aa  54.3  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  72.5 
 
 		 1007 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  44.93 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  70 
 
 		 516 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  70 
 
 		 536 aa  52.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  48.57 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  34.44 
 
 		 385 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  29.84 
 
 		 590 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  54.76 
 
 		 397 aa  47.8  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  63.16 
 
 		 645 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1639  hypothetical protein  42.86 
 
 		 374 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.640839  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3056  pyocin R2_PP, tail fiber protein, putative  35.9 
 
 		 292 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>