46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2885 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  100 
 
 		 462 aa  911    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  70.97 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  69.84 
 
 		 689 aa  326  5e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  63.03 
 
 		 697 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  78.26 
 
 		 682 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  57.14 
 
 		 473 aa  204  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  56.35 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  56.35 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  63.95 
 
 		 588 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  77.12 
 
 		 660 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  60.24 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  62.96 
 
 		 570 aa  97.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  64.94 
 
 		 673 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  37.11 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  36.08 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  51.16 
 
 		 561 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  38.33 
 
 		 962 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  67.86 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  51.76 
 
 		 790 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  36.49 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  33.89 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  59.15 
 
 		 646 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  54.17 
 
 		 892 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  49.41 
 
 		 791 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  62.32 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  35.88 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  44.44 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  66.67 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  60.42 
 
 		 735 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  52.78 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1088  hypothetical protein  54.17 
 
 		 712 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.979712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1223  hypothetical protein  48.28 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  35.57 
 
 		 805 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  53.62 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  46.77 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  42.53 
 
 		 498 aa  57  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  76.47 
 
 		 536 aa  53.9  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  73.53 
 
 		 516 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  76.47 
 
 		 172 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  43.94 
 
 		 397 aa  50.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  47.27 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  41.98 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  53.06 
 
 		 701 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  34.17 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  60.61 
 
 		 1120 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  52.63 
 
 		 714 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>