46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2783 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  95.04 
 
 
701 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  91.79 
 
 
413 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  100 
 
 
670 aa  1369    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  99.7 
 
 
670 aa  1364    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  86.23 
 
 
588 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  82.9 
 
 
561 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  46.67 
 
 
589 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  45.48 
 
 
690 aa  280  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  41.53 
 
 
531 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  43.45 
 
 
654 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  42.66 
 
 
768 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  43.07 
 
 
654 aa  207  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  40 
 
 
808 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  36.51 
 
 
527 aa  204  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  38.85 
 
 
804 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  38.23 
 
 
465 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  36.74 
 
 
609 aa  191  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  37.25 
 
 
612 aa  186  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  44.87 
 
 
268 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  28.69 
 
 
469 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  40.94 
 
 
249 aa  97.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  62.86 
 
 
1120 aa  81.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  62.86 
 
 
1137 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  68.85 
 
 
1007 aa  80.5  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  30.07 
 
 
190 aa  77  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  41.32 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  72.92 
 
 
673 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  72.92 
 
 
570 aa  74.3  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  52.63 
 
 
583 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  55.26 
 
 
554 aa  73.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  52.11 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  52.11 
 
 
581 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  52.11 
 
 
493 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  65 
 
 
660 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  49.33 
 
 
516 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  60 
 
 
172 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  53.73 
 
 
536 aa  53.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  35.94 
 
 
304 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  74.29 
 
 
645 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  31.15 
 
 
364 aa  51.2  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  71.43 
 
 
401 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  61.36 
 
 
962 aa  48.5  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  71.43 
 
 
401 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  42.11 
 
 
514 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  42.11 
 
 
520 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  67.86 
 
 
621 aa  44.3  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>