19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0257 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 609 aa  1246    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  60.42 
 
 		 527 aa  336  7e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  61.32 
 
 		 465 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  48.52 
 
 		 654 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  40 
 
 		 808 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  48.1 
 
 		 654 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  37.5 
 
 		 701 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  35.26 
 
 		 670 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  35.16 
 
 		 670 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  38.43 
 
 		 589 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  33.57 
 
 		 690 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  36.71 
 
 		 768 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  34 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  35.31 
 
 		 804 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  40.88 
 
 		 268 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  28.25 
 
 		 612 aa  99.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  39.49 
 
 		 249 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  67  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15410  hypothetical protein  32.89 
 
 		 963 aa  61.6  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.131218  normal  0.0258351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>