18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05044 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  47.47 
 
 
654 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  47.47 
 
 
654 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  45.86 
 
 
808 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  46.67 
 
 
804 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  44.87 
 
 
670 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  44.59 
 
 
670 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  44.59 
 
 
701 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  42.68 
 
 
527 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  42.04 
 
 
465 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  44.3 
 
 
690 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  42.68 
 
 
768 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  40.88 
 
 
609 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  34.21 
 
 
531 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  37.58 
 
 
589 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  35 
 
 
190 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  42.42 
 
 
249 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  34.06 
 
 
612 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>