21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1451 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1451  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  950    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.331514  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  97.18 
 
 
527 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0257  hypothetical protein  61.11 
 
 
609 aa  335  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  44.37 
 
 
654 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  44.01 
 
 
654 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  41.84 
 
 
808 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  38.91 
 
 
701 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  38.44 
 
 
670 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  38.23 
 
 
670 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0740  hypothetical protein  39.3 
 
 
804 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  36.1 
 
 
690 aa  181  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1302  hypothetical protein  38.68 
 
 
768 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  38.83 
 
 
589 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0930  tail fiber repeat 2-containing protein  33.33 
 
 
531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627333  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05044  hypothetical protein  42.04 
 
 
268 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  44.69 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1037  hypothetical protein  27.94 
 
 
612 aa  106  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0716  hypothetical protein  41.61 
 
 
249 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.716987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0570  hypothetical protein  30.52 
 
 
190 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.2378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  33.94 
 
 
817 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  51.16 
 
 
498 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>