35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2246 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  90.96 
 
 		 520 aa  950    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  100 
 
 		 514 aa  1041    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  70.36 
 
 		 892 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  60.31 
 
 		 701 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  93.28 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  61.11 
 
 		 962 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  94.39 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  43.9 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  57.24 
 
 		 516 aa  167  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  57.24 
 
 		 536 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  60.58 
 
 		 172 aa  130  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  27.14 
 
 		 469 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  43.26 
 
 		 229 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  66.15 
 
 		 262 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0710  gpH  32.16 
 
 		 157 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  45.68 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  37.04 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  43.82 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  54.55 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  69.23 
 
 		 280 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  60.47 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  58.14 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  58.14 
 
 		 805 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  35.37 
 
 		 320 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  35.71 
 
 		 298 aa  50.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  26.55 
 
 		 689 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  29.92 
 
 		 363 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  41.43 
 
 		 168 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  42.11 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  42.11 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  59.46 
 
 		 682 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  32.47 
 
 		 261 aa  45.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  25.87 
 
 		 238 aa  45.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  32.47 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  38.14 
 
 		 621 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>