26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2809 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  95.28 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  96.15 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  57.94 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  58.21 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  57.89 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  34.83 
 
 		 229 aa  72  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  34.34 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  66.67 
 
 		 479 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2185  hypothetical protein  68.97 
 
 		 95 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1868  hypothetical protein  39.29 
 
 		 290 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  hitchhiker  0.000000000000451557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  39.29 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  40 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  44.26 
 
 		 589 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  30.69 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1164  hypothetical protein  35.48 
 
 		 383 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  44.26 
 
 		 408 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  29.3 
 
 		 492 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3858  tail fiber protein, putative  38.57 
 
 		 267 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.642523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  25.87 
 
 		 514 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  35.71 
 
 		 430 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  39.58 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  25.87 
 
 		 520 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1170  carbohydrate-binding, CenC-like  33.33 
 
 		 400 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  28.32 
 
 		 364 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  28.03 
 
 		 413 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>