19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3044 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2745  hypothetical protein  49.63 
 
 
499 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.971927  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  43.59 
 
 
229 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0551866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  40.58 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  36.05 
 
 
363 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  41.27 
 
 
430 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  35.37 
 
 
514 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  35.37 
 
 
364 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  35.37 
 
 
520 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  36.36 
 
 
413 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  43.18 
 
 
200 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  40.62 
 
 
408 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  39.29 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  39.29 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  39.29 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  33.78 
 
 
168 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1868  hypothetical protein  44.26 
 
 
290 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  hitchhiker  0.000000000000451557 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  27.97 
 
 
263 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3858  tail fiber protein, putative  38.6 
 
 
267 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.642523  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>