41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0183 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  100 
 
 		 408 aa  815    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  78.68 
 
 		 363 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  73.9 
 
 		 589 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  43.71 
 
 		 402 aa  99.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  47.06 
 
 		 479 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2185  hypothetical protein  53.85 
 
 		 95 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  36.46 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  43.81 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  78.95 
 
 		 1007 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  83.33 
 
 		 536 aa  53.5  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  83.33 
 
 		 516 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  73.17 
 
 		 1137 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  73.17 
 
 		 1120 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  75 
 
 		 645 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  82.35 
 
 		 570 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  69.05 
 
 		 583 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  32.18 
 
 		 280 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  76.47 
 
 		 805 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  76.47 
 
 		 892 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  38.68 
 
 		 580 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  48.57 
 
 		 673 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  40.62 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  36.49 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  69.23 
 
 		 962 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  75.76 
 
 		 791 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  72.73 
 
 		 552 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1164  hypothetical protein  39.06 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  65.79 
 
 		 701 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  44.26 
 
 		 238 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  64.1 
 
 		 172 aa  46.6  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  67.57 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  67.57 
 
 		 790 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  32.89 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1170  carbohydrate-binding, CenC-like  38.33 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  70.27 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  70.27 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  52.08 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  44.12 
 
 		 581 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  36 
 
 		 263 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  34.92 
 
 		 259 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  34.92 
 
 		 259 aa  42.7  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>