71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2794 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  90.39 
 
 
805 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  96.84 
 
 
791 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  100 
 
 
790 aa  1568    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  87.04 
 
 
463 aa  838    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  97.24 
 
 
569 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  96.22 
 
 
892 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  72.58 
 
 
442 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  59.63 
 
 
1007 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  58.44 
 
 
320 aa  331  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  45.18 
 
 
580 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  57.39 
 
 
281 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  62.28 
 
 
401 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  62.28 
 
 
401 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  75.48 
 
 
280 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  57.72 
 
 
1120 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  55.51 
 
 
1137 aa  253  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  59.83 
 
 
411 aa  251  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  38.29 
 
 
536 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  55.13 
 
 
441 aa  243  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  59.12 
 
 
1258 aa  236  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  57.89 
 
 
516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  57.74 
 
 
451 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  57.74 
 
 
437 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  55.84 
 
 
845 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.116414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  57.81 
 
 
438 aa  222  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  57.32 
 
 
407 aa  220  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  57.32 
 
 
437 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  57.32 
 
 
434 aa  219  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  47.84 
 
 
962 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  56.49 
 
 
439 aa  217  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  56.07 
 
 
437 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  84.55 
 
 
198 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  49.19 
 
 
673 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  43.65 
 
 
570 aa  148  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  58.04 
 
 
540 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  58.04 
 
 
540 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  61.62 
 
 
473 aa  122  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  58.04 
 
 
588 aa  120  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  52.13 
 
 
399 aa  103  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  47.32 
 
 
561 aa  95.1  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  48.21 
 
 
689 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  54.22 
 
 
621 aa  86.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  51.76 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  37.06 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  54.05 
 
 
697 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  40 
 
 
522 aa  72  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  37.38 
 
 
682 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  49.25 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  30.77 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  49.28 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  31.12 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  30.77 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  26.08 
 
 
645 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  35.9 
 
 
259 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  38.32 
 
 
336 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  42.53 
 
 
352 aa  65.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  52.94 
 
 
401 aa  64.7  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  47.76 
 
 
557 aa  64.3  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  50 
 
 
340 aa  64.3  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  35.34 
 
 
259 aa  64.3  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  29.67 
 
 
166 aa  63.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  52 
 
 
646 aa  63.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  31.05 
 
 
262 aa  62  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  61.22 
 
 
172 aa  58.9  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  56.14 
 
 
340 aa  57.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  62.79 
 
 
639 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  42.39 
 
 
552 aa  51.6  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  35.96 
 
 
385 aa  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  65.12 
 
 
583 aa  47.8  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  33.14 
 
 
762 aa  46.6  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  66.67 
 
 
581 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>