60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0710 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  100 
 
 		 892 aa  1788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  70.57 
 
 		 514 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  96.42 
 
 		 791 aa  572  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  96.22 
 
 		 790 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  90.29 
 
 		 805 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  67.46 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  58.07 
 
 		 962 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  72.27 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  91.62 
 
 		 280 aa  317  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  81.82 
 
 		 463 aa  283  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  62.28 
 
 		 401 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  62.28 
 
 		 401 aa  279  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  58.47 
 
 		 411 aa  248  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  72.22 
 
 		 1007 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  60.66 
 
 		 1258 aa  233  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  73.08 
 
 		 1137 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  76.81 
 
 		 1120 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  56.07 
 
 		 451 aa  220  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  57.32 
 
 		 437 aa  219  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  57.38 
 
 		 438 aa  219  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  55.65 
 
 		 407 aa  218  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  59.36 
 
 		 845 aa  218  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  56.9 
 
 		 437 aa  217  9e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  55.65 
 
 		 434 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  55.65 
 
 		 439 aa  214  5.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  76.81 
 
 		 442 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  55.23 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  40.9 
 
 		 516 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  83.64 
 
 		 198 aa  201  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  40.6 
 
 		 536 aa  197  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  56.02 
 
 		 701 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  51.63 
 
 		 673 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  43.87 
 
 		 570 aa  145  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  60.58 
 
 		 172 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  59.48 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  59.48 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  58.77 
 
 		 473 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  60.36 
 
 		 588 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0710  gpH  43.95 
 
 		 157 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  53.12 
 
 		 399 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  30.29 
 
 		 689 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  43.41 
 
 		 621 aa  94  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  49.55 
 
 		 561 aa  93.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  42.86 
 
 		 697 aa  86.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  54.17 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  36.47 
 
 		 468 aa  77  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  46.39 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  43.84 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  25.68 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  29.31 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  37.38 
 
 		 336 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  41.38 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  56.14 
 
 		 340 aa  56.6  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  43.01 
 
 		 552 aa  54.3  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  39.19 
 
 		 493 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  33.64 
 
 		 385 aa  52  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  58 
 
 		 580 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  66.67 
 
 		 581 aa  48.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  33.14 
 
 		 762 aa  45.8  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  62.79 
 
 		 583 aa  44.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>