50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2427 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  85.5 
 
 		 892 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  78.69 
 
 		 463 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  80.1 
 
 		 805 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  89.51 
 
 		 791 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  87.65 
 
 		 790 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  60.99 
 
 		 962 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  57.39 
 
 		 442 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  71.29 
 
 		 1007 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  51.63 
 
 		 673 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  66.97 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  43.56 
 
 		 697 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  62.39 
 
 		 682 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  48.15 
 
 		 570 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  58.62 
 
 		 540 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  58.62 
 
 		 540 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  56.78 
 
 		 473 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  58.65 
 
 		 588 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  51 
 
 		 399 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  43.41 
 
 		 621 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  48.57 
 
 		 561 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  53.41 
 
 		 689 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  76.36 
 
 		 1137 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  79.25 
 
 		 1120 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  52.78 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  69.64 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  69.64 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  45.36 
 
 		 522 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  71.05 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  34.55 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  69.23 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  69.23 
 
 		 514 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  80 
 
 		 536 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  80 
 
 		 516 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  63.64 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  58.18 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  57.45 
 
 		 552 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  56.86 
 
 		 580 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  65.79 
 
 		 581 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  65.79 
 
 		 493 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  54.55 
 
 		 639 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  54.17 
 
 		 469 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  76.47 
 
 		 408 aa  48.9  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  64.86 
 
 		 645 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  54.55 
 
 		 701 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  77.42 
 
 		 583 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  68.75 
 
 		 589 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  64.71 
 
 		 670 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  64.71 
 
 		 670 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  63.64 
 
 		 554 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>