20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1451 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  520  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  57.89 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  57.89 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  57.89 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0710  gpH  44.44 
 
 		 157 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  48.48 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  47.62 
 
 		 673 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  44.93 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2597  Bcv gene product  53.85 
 
 		 39 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1756  hypothetical protein  48.15 
 
 		 683 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  42.37 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  34.85 
 
 		 430 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  36 
 
 		 408 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  36.84 
 
 		 413 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  32.47 
 
 		 514 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  32.47 
 
 		 520 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  36.84 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3858  tail fiber protein, putative  33.33 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.642523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  42.55 
 
 		 168 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  36.36 
 
 		 320 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>