36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2249 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  90.96 
 
 		 514 aa  950    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  100 
 
 		 520 aa  1049    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  66.98 
 
 		 892 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2918  gp19  73.15 
 
 		 701 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217612  hitchhiker  0.00000000528807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  92.54 
 
 		 364 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1178  side tail fiber protein  53.66 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.102671 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  60 
 
 		 962 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  95.33 
 
 		 413 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  57.64 
 
 		 516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  57.64 
 
 		 536 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  27.91 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  60.58 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  43.26 
 
 		 229 aa  99  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  66.15 
 
 		 262 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0710  gpH  34.34 
 
 		 157 aa  87  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  37.96 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  43.82 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  39.51 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  69.23 
 
 		 280 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  54.55 
 
 		 200 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  60.47 
 
 		 442 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  58.14 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  58.14 
 
 		 805 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  35.37 
 
 		 320 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  35.71 
 
 		 298 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  29.92 
 
 		 363 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  41.43 
 
 		 168 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  42.11 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  42.11 
 
 		 670 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  59.46 
 
 		 682 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  32.47 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  32.47 
 
 		 261 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  38.14 
 
 		 621 aa  44.3  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  25.87 
 
 		 238 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  26.81 
 
 		 588 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  26.81 
 
 		 561 aa  43.5  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>