21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2473 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  91.79 
 
 		 670 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  92.08 
 
 		 670 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  843    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  87.43 
 
 		 588 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  87.71 
 
 		 561 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  67.44 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  95.33 
 
 		 520 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  94.39 
 
 		 514 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  66.15 
 
 		 262 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  58.44 
 
 		 229 aa  93.6  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  25 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  49.32 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  30.26 
 
 		 554 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  54.55 
 
 		 200 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  35.94 
 
 		 304 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  36.36 
 
 		 320 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  41.82 
 
 		 298 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  41.43 
 
 		 168 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  36.84 
 
 		 263 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  32.89 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  28.03 
 
 		 238 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>