20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3111 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  78.68 
 
 		 408 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0914  tail fiber repeat 2-containing protein  74.28 
 
 		 589 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  57.94 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  57.94 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  57.94 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  47.06 
 
 		 479 aa  92.8  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  42.38 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  47.76 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2185  hypothetical protein  53.85 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  44.93 
 
 		 263 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  32.85 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1164  hypothetical protein  35 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4483  probable phage tail fiber protein  26.05 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  42.11 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1170  carbohydrate-binding, CenC-like  36.84 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2246  tail protein  29.92 
 
 		 514 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2249  tail protein  29.92 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0759311  normal  0.0336742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  33.9 
 
 		 364 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1868  hypothetical protein  42.37 
 
 		 290 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  hitchhiker  0.000000000000451557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>