26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1166 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  726    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4585  hypothetical protein  54.55 
 
 		 440 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  49.63 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1164  hypothetical protein  69.57 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1170  carbohydrate-binding, CenC-like  69.57 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  47.27 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  40.15 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  47.22 
 
 		 735 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  42.22 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  35.42 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  35.42 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  31.76 
 
 		 225 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  37.61 
 
 		 817 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  32.14 
 
 		 554 aa  54.3  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  39.29 
 
 		 483 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  37.68 
 
 		 430 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  36.89 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2442  hypothetical protein  34.09 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  33.9 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  32.89 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  46.43 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  30.61 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  30.61 
 
 		 259 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  32.23 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  28.32 
 
 		 238 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  32.74 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>