59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1862 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 735 aa  1469    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  53.28 
 
 		 536 aa  267  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  52.83 
 
 		 790 aa  246  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  37.96 
 
 		 483 aa  120  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  48.41 
 
 		 387 aa  117  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  33.18 
 
 		 654 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  33.18 
 
 		 654 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  31.73 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4585  hypothetical protein  47.92 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  38.46 
 
 		 557 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  29.95 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  51.25 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  39.84 
 
 		 646 aa  71.6  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  35.71 
 
 		 554 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  30.37 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  37.6 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1223  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388112  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1250  tail collar domain-containing protein  26.41 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  26.41 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  58 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  43.14 
 
 		 505 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  58 
 
 		 682 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  30.42 
 
 		 817 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  28.04 
 
 		 262 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  26.29 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  26.29 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  26.98 
 
 		 177 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1283  phage-related tail fiber protein  27.31 
 
 		 414 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  46.43 
 
 		 689 aa  57  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  26.98 
 
 		 176 aa  57  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  33.61 
 
 		 401 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  37.27 
 
 		 621 aa  55.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  36.36 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  30.12 
 
 		 472 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  38 
 
 		 498 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  35 
 
 		 282 aa  52.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  34.69 
 
 		 261 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  34.97 
 
 		 371 aa  52.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  36.14 
 
 		 264 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1088  hypothetical protein  46.15 
 
 		 712 aa  51.6  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.979712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  34.72 
 
 		 300 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  38.2 
 
 		 183 aa  50.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  30 
 
 		 300 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  25.79 
 
 		 166 aa  50.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  35.38 
 
 		 340 aa  49.3  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 		 259 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 		 259 aa  48.9  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  33.94 
 
 		 340 aa  48.5  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  26.36 
 
 		 439 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  39.19 
 
 		 1137 aa  47.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  39.19 
 
 		 1120 aa  47.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  30.82 
 
 		 368 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1105  Tail Collar domain protein  27.8 
 
 		 200 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  24.58 
 
 		 1007 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  36.67 
 
 		 196 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  33.96 
 
 		 899 aa  45.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  27.15 
 
 		 580 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  26.61 
 
 		 516 aa  44.3  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  37.25 
 
 		 530 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>