115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5767 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5767  putative phage tail Collar domain  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3075  putative phage tail collar domain  45.72 
 
 
326 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.242473  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  42.08 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  40.21 
 
 
300 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  31.91 
 
 
414 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  35.27 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0240  microcystin-dependent protein-like  31.77 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  33.52 
 
 
178 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1749  Tail Collar domain protein  32.6 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  40.17 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6751  hypothetical protein  29.13 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  32.28 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  28.8 
 
 
169 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  37.96 
 
 
165 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  32.99 
 
 
199 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0703  Tail Collar domain protein  30.6 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  31.29 
 
 
492 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  45.05 
 
 
163 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  30.46 
 
 
171 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  33.52 
 
 
175 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  45.33 
 
 
654 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  45.33 
 
 
654 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  31.69 
 
 
163 aa  62.8  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  41.58 
 
 
176 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  39.25 
 
 
181 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  40.66 
 
 
169 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  28.8 
 
 
186 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  32.47 
 
 
199 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  32.47 
 
 
199 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  32.47 
 
 
199 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  41.58 
 
 
157 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  53.85 
 
 
554 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  31.02 
 
 
176 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  32.65 
 
 
181 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  40.66 
 
 
196 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  29.95 
 
 
170 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  30.94 
 
 
169 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  30.05 
 
 
174 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  39.77 
 
 
195 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  37.04 
 
 
189 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  43.02 
 
 
199 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  27.81 
 
 
179 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  37.04 
 
 
189 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  37.36 
 
 
171 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  28.04 
 
 
173 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  39.6 
 
 
172 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  41.86 
 
 
197 aa  56.6  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  32.53 
 
 
181 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  32.05 
 
 
224 aa  55.8  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  35.94 
 
 
206 aa  55.8  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  31.25 
 
 
168 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  36.11 
 
 
199 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  29.47 
 
 
173 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  49.06 
 
 
225 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  31.96 
 
 
198 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  31.61 
 
 
179 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  31.25 
 
 
180 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 
170 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  35.85 
 
 
173 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  40.59 
 
 
172 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  33.01 
 
 
1065 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  36.63 
 
 
170 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  34.91 
 
 
183 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 
207 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  56.9 
 
 
195 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  31.48 
 
 
175 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  36.11 
 
 
171 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  38.71 
 
 
181 aa  52.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  29.02 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  38.05 
 
 
205 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  30.61 
 
 
177 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  31.48 
 
 
196 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  38.46 
 
 
167 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  28.66 
 
 
179 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  41.76 
 
 
173 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  38.71 
 
 
176 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  33.54 
 
 
178 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  42.03 
 
 
501 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0481  Tail Collar domain protein  32.14 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  40.7 
 
 
192 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  37.62 
 
 
166 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  30 
 
 
735 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  25.5 
 
 
323 aa  49.7  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  37.21 
 
 
183 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  39.08 
 
 
176 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  34.95 
 
 
182 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  43.59 
 
 
195 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0919  hypothetical protein  29.76 
 
 
318 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  32.74 
 
 
180 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  37.23 
 
 
195 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0480  Tail Collar domain protein  30.53 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  26.13 
 
 
671 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  31.4 
 
 
181 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  36.99 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  34.07 
 
 
210 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  31.17 
 
 
184 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  38.37 
 
 
172 aa  47  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  36.46 
 
 
176 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  35.64 
 
 
177 aa  45.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1013  tail collar domain-containing protein  35.56 
 
 
387 aa  45.8  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>