28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0691 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  693    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  30.77 
 
 		 540 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  30.77 
 
 		 540 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  36.49 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  48.42 
 
 		 588 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  43.3 
 
 		 570 aa  70.1  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  60.66 
 
 		 673 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  27.59 
 
 		 689 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  39.8 
 
 		 697 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  62.96 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  34.57 
 
 		 621 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  60.78 
 
 		 962 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  62.75 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  63.04 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  56.14 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  50.88 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  56.14 
 
 		 791 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  56.14 
 
 		 892 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  50.68 
 
 		 561 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  56.45 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  49.25 
 
 		 639 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  58.18 
 
 		 280 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  41.77 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  56.86 
 
 		 805 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  35.38 
 
 		 735 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  47.62 
 
 		 522 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1223  hypothetical protein  39.06 
 
 		 145 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1088  hypothetical protein  43.48 
 
 		 712 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.979712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>