65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0745 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  763    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  48.41 
 
 		 735 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  46.03 
 
 		 536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  58.89 
 
 		 790 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  36.2 
 
 		 225 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  41.18 
 
 		 492 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  36.51 
 
 		 483 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  32.91 
 
 		 554 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  31.64 
 
 		 817 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  33.99 
 
 		 505 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  33.01 
 
 		 654 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  33.01 
 
 		 654 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  32.04 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  32.93 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  31.15 
 
 		 176 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  32.43 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  32.43 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4585  hypothetical protein  47.56 
 
 		 440 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  31.58 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  27.88 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  32.63 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3903  hypothetical protein  35.53 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0432059  normal  0.0187959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  27.51 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  31.79 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  30.27 
 
 		 646 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  28.09 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  37.27 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  28.64 
 
 		 689 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  30.38 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  30.77 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0691  hypothetical protein  63.04 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2356  variable tail fibre protein  49.18 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164257  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  35.45 
 
 		 621 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  29.27 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  28.99 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  50.91 
 
 		 697 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  38.1 
 
 		 498 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  37.5 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  58.33 
 
 		 673 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  58.33 
 
 		 570 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  31.58 
 
 		 402 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  34.02 
 
 		 472 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  60 
 
 		 588 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  35 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  55.32 
 
 		 962 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  57.45 
 
 		 540 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  57.45 
 
 		 540 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  55.32 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  36.14 
 
 		 183 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  71.88 
 
 		 522 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  74.19 
 
 		 561 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  31.19 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  27.46 
 
 		 196 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  31.16 
 
 		 282 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  53.49 
 
 		 892 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  53.49 
 
 		 791 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  44.19 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  53.19 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  48.84 
 
 		 790 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  51.06 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  31.07 
 
 		 169 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  30.85 
 
 		 264 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  24.5 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0519  Tail Collar domain protein  32.81 
 
 		 443 aa  42.7  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>