23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2331 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2331  bacteriophage tail fiber protein  100 
 
 		 385 aa  756    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  34.89 
 
 		 697 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1814  hypothetical protein  40.91 
 
 		 499 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189604  hitchhiker  0.000566179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  40.46 
 
 		 540 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  40.46 
 
 		 540 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  38.93 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2885  putative bacteriophage tail fiber protein  33.11 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  43.82 
 
 		 962 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 689 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  35.14 
 
 		 621 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  36.89 
 
 		 463 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  35 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  42.42 
 
 		 673 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  56.82 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  39.51 
 
 		 442 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  38.64 
 
 		 570 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  36.9 
 
 		 588 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  30.27 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  52.5 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  57.5 
 
 		 714 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6579  hypothetical protein  35.77 
 
 		 522 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  61.54 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  38.71 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>