55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4042 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  100 
 
 
714 aa  1427    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  66.87 
 
 
689 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  55.48 
 
 
554 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  47.29 
 
 
817 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  66.22 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  65.36 
 
 
401 aa  195  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  59.39 
 
 
660 aa  194  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  58.93 
 
 
340 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  60 
 
 
399 aa  190  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  58.14 
 
 
419 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  62.75 
 
 
498 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  60.39 
 
 
479 aa  188  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  62.84 
 
 
697 aa  188  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  58.14 
 
 
646 aa  187  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  56.6 
 
 
583 aa  184  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  63.4 
 
 
557 aa  182  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  57.42 
 
 
540 aa  177  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  57.42 
 
 
540 aa  177  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  58.44 
 
 
485 aa  177  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  57.79 
 
 
473 aa  177  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  56.49 
 
 
588 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  52.26 
 
 
371 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  56.49 
 
 
561 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  53.5 
 
 
452 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  49.4 
 
 
504 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  34.44 
 
 
570 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  48.24 
 
 
691 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  48.73 
 
 
554 aa  147  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  50.38 
 
 
673 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  43.51 
 
 
251 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  48.06 
 
 
580 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  38.99 
 
 
552 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  39.51 
 
 
493 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  38.89 
 
 
581 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2930  prophage MuMc02, head decoration protein, putative  51.97 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  37.5 
 
 
205 aa  94.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  31.85 
 
 
483 aa  89  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  36.84 
 
 
242 aa  86.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0231  tail fiber protein H, putative  32.89 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.218449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  35.29 
 
 
505 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  28.45 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2748  hypothetical protein  33.01 
 
 
527 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.873597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2490  hypothetical protein  38.1 
 
 
745 aa  79.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  31.95 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3731  tail fiber protein, putative  32.99 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  33.57 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  31.51 
 
 
525 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  28.66 
 
 
519 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  49.28 
 
 
5203 aa  61.6  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  45.59 
 
 
5166 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  31.21 
 
 
590 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0558  hypothetical protein  50 
 
 
397 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209812  hitchhiker  0.0000583469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  63.16 
 
 
621 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4006  tail fiber protein H, putative  44 
 
 
808 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  57.89 
 
 
689 aa  44.3  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>